Władzami Oddziału Warszawskiego SEP są: Walne Zgromadzenie Oddziału (WZO) i Zarząd Oddziału. Organem kontrolnym jest Komisja Rewizyjna Oddziału. Organem orzekającym w sprawach o przewinienia dotyczące zasad etyki jest Sąd Koleżeński Oddziału.
Zarząd Oddziału Warszawskiego
Prezes - mgr inż. Przemysław Klukowski Wiceprezes - mgr inż. Andrzej Englert Skarbnik - mgr inż. Monika Sadurska Sekretarz - mgr inż. Konrad Krupa Członek Zarządu - doc. dr inż. Wiesław Brociek Członek Zarządu - dr inż. Tomasz Kisielewicz Członek Zarządu - mgr inż. Ludwik Osmólski
Komisja Rewizyjna Oddziału
Przewodniczący - mgr inż. Bogdan Kamiński Zastępca Przewodniczącego - mgr inż. Artur Moradewicz Sekretarz - mgr inż. Adam Pieścik Członek - mgr Ewa Materska Członek - mgr inż. Tomasz Skomorowski
Sąd Koleżeński Oddziału
Przewodniczący - mgr inż. Barbara Halicka - Pękala Zastępca Przewodniczącego - mgr inż. Ryszard Marcińczak Sekretarz - dr hab. inż. Sławomir Bielecki Członek - mgr inż. Tomasz Moczulski
Organami doradczymi i roboczymi Zarządu Oddziału są oddziałowe sekcje i komisje.
